При сравнительном изучении отношений размеров правого и левого желудочков, атриовентрикулярных клапанов и главных артерий не получено достоверных различий между плодами с атрезией и с выраженным стенозом легочной артерии, что свидетельствует о невозможности дифференциальной диагностики обструктивных поражений выходного тракта правого желудочка на основании только данных двухмерной эхографии. Существенную помощь в дифференцировании атрезии и выраженного стеноза легочной артерии оказывает допплерэхо-кардиография. Диагноз стеноза легочной артерии может быть установлен, если при допплеровском исследовании обнаруживается антеградный кровоток из правого желудочка в легочную артерию, но если он не регистрируется, что имело место в 50% случаев выраженного клапанного стеноза, пренатальная дифференциальная диагностика атрезии и стеноза легочной артерии невозможна.
